Weterynaryjne laboratorium diagnostyczne jako wytwórca odpadów jest zobowiązane do gospodarowania wytworzonymi przez siebie odpadami i odpowiedzialności za nie. Gospodarkę odpadami należy prowadzić w sposób zapewniający ochronę życia i zdrowia ludzi oraz środowiska. Obrót odpadami powinien uwzględniać również inny istotny czynnik – hierarchię postępowania z odpadami. W pierwszej kolejności należy zapobiegać powstawaniu odpadów lub ograniczyć ich ilość oraz negatywne oddziaływanie na ludzi i środowisko. Ta sama zasada dotyczy laboratoriów. Aby zmniejszyć ilość odpadów weterynaryjnych, należy np. wyeliminować z ich strumienia odpady komunalne.